Das Dorf Serkendorf liegt 7 km Luftlinie 110,9 ° östlich von Bad Staffelstein entfernt. Das Dorf befindet sich im Döbertengrund, der vom wasserreichen Döbertenbach in Richtung Westen durchflossen wird. Die Kreisstraße von Stublang nach Lahm quert den Ort. Den Dorfbrunnen speist die Hopfenquelle. Folgende Straßen führen in der Nähe von Serkendorf vorbei oder direkt dort hin: LIF 16 und Gemeindeverbindungsstraßen.